RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 FGFBP1Q14512 234 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 NNATQ16517 81 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 OVCH1Q7RTY7 1134 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZER1Q7Z7L7 766 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 CMIPQ8IY22 773 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 SCN3BQ9NY72 215 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF6Q9Y252 685 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPRKBQ9Y3C4 175 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 BDP1A6H8Y1 2624 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRAPPC13A5PLN9 417 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 FRG2CA6NGY1 282 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMP11P24347 488 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDC42P60953 191 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF730Q6ZMV8 503 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF614Q8N883 585 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF559Q9BR84 538 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUDT9Q9BW91 350 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 HOXD1Q9GZZ0 328 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 APMAPQ9HDC9 416 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 R4GN57 208 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR6C76A6NM76 312 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 GKN3PP0CG01 181 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 TEKQ02763 1124 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1N1Q8NGS0 311 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 NTNG1Q9Y2I2 539 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCB7O75027 752 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 HEXBP07686 556 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 IDH2P48735 452 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1Q1Q15612 314 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 LAIR1Q6GTX8 287 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIGXQ8TBF5 258 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADIPOR1Q96A54 375 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 RASSF1Q9NS23 344 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 IL33O95760 270 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 FMO3P31513 532 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 BMPERQ8N8U9 685 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHOXF1Q8NHV9 184 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 VCX3AQ9NNX9 186 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 IMPAD1Q9NX62 359 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC7A7Q9UM01 511 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 VSTM2BA6NLU5 285 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPZL2O60487 215 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 THY1P04216 161 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRG2P13727 222 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 POU1F1P28069 291 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 HTR2AP28223 471 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSSP48637 474 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 BORAQ6PGQ7 559 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF550Q7Z398 422 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 P3H2Q8IVL5 708 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 NKAIN4Q8IVV8 208 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF31Q96EP0 1072 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC26A1Q9H2B4 701 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM27Q9HBJ8 222 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 WBP4O75554 376 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 LCN1P31025 176 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 MC2RQ01718 297 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLAURQ03405 335 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 EBPQ15125 230 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF613Q6PF04 617 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 LANCL3Q6ZV70 420 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC29A4Q7RTT9 530 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 APH1BQ8WW43 257 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXO8Q9NRD0 319 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 IDSB3KWA1 339 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 H3BN98 237 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALOX12BO75342 701 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYC1P08574 325 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSPAN31Q12999 210 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCTD8Q6ZWB6 473 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF527Q8NB42 609 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 METTL21AQ8WXB1 218 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBE2FQ969M7 185 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 RXFP3Q9NSD7 469 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERINC4A6NH21 518 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUBP1P53384 320 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLX4IPQ5VYV7 408 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD37Q7Z713 158 aa26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms