RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572787.1

TOPBP1-210, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 4

Gene TOPBP1, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-210	ENST00000572787	CXADR	P78310	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SRY	Q05066	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	TRAM2	Q15035	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	TMED2	Q15363	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	MYLIP	Q8WY64	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	NR4A3	Q92570	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	NUS1	Q96E22	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	NANS	Q9NR45	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	PTPRC	P08575	1304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787		A0A0J9YVX5	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787		H0YL77	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	AIRE	O43918	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ENTPD5	O75356	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	DEXI	O95424	95 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	F10	P00742	488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	OCM2	P0CE71	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	KITLG	P21583	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	EPHX2	P34913	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SFTPD	P35247	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ACVR1B	P36896	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	CEACAM3	P40198	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SOX2	P48431	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	VAMP7	P51809	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	JAG1	P78504	1218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	KLC1	Q07866	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	NAB1	Q13506	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SPCS2	Q15005	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	PDK2	Q15119	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	PHKG1	Q16816	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	IMPG1	Q17R60	797 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	OR4A47	Q6IF82	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-210	ENST00000572787	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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