RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SCDO00767 359 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SOX30O94993 753 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 OR12D1P0DN82 309 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 GABRA1P14867 456 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 HPGDP15428 266 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 HK1P19367 917 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 GCKP35557 465 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 STARP49675 285 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 B3GALT5-AS1P59052 145 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CD226Q15762 336 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5M1Q8NGP8 315 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 MIPOL1Q8TD10 442 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB8BQ92930 207 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 VPS33AQ96AX1 596 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 NEURL3Q96EH8 262 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SFXN2Q96NB2 322 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC28BQ9BUN5 200 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 COQ3Q9NZJ6 369 aa16.87■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 DUXAA6NLW8 204 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 AHRRA9YTQ3 701 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CLDN14O95500 239 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 HTR1EP28566 365 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 DCTP40126 519 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ADH7P40394 386 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SRYQ05066 204 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF787Q6DD87 383 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SEM1Q6ZVN7 128 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 PM20D2Q8IYS1 436 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 RFWD2Q8NHY2 731 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 XAGE5Q8WWM1 108 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 DTNBP1Q96EV8 351 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 KLHDC3Q9BQ90 382 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 PTGES2Q9H7Z7 377 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 MED12Q93074 2177 aa16.86■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A0G2JNJ9 132 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PQD3 144 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM234BA2RU67 622 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 RFXANKO14593 260 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 FCMRO60667 390 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CPN1P15169 458 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 PTGER4P35408 488 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 LHX2P50458 406 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 STX1BP61266 288 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC74AQ0VAA2 488 aa16.85■□□□□ 0.29
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GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 KLHL26Q53HC5 615 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 RAET1LQ5VY80 246 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 AAGABQ6PD74 315 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ARSKQ6UWY0 536 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF130Q86XS8 419 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 NPHS2Q9NP85 383 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 Q9UFV3 132 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 DCTN4Q9UJW0 460 aa16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 SHISA8B8ZZ34 492 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 NPIPB9F8W1W9 429 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 OIP5O43482 229 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 TOXO94900 526 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 EPPINO95925 133 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CHMP24386 653 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 CHRNB4P30926 498 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 KHKP50053 298 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ATP12AP54707 1039 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 FUT5Q11128 374 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR68Q15743 365 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ENPP6Q6UWR7 440 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 C16orf62Q7Z3J2 963 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF527Q8NB42 609 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIB1Q96RU8 372 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 TUBA1CQ9BQE3 449 aa16.84■□□□□ 0.29
GCSHP2-201ENST00000560971 UCK2Q9BZX2 261 aa16.84■□□□□ 0.29
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