RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN20	P56880	219 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB13	P59910	316 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HERVK_113	P63132	956 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CBX1	P83916	185 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CDKL1	Q00532	357 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	BST1	Q10588	318 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	STX3	Q13277	289 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KRT33B	Q14525	404 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ELOC	Q15369	112 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EGFL8	Q99944	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TRIO	O75962	3097 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PI4KA	P42356	2102 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0G2JNG1	304 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1W2PPV9	198 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	BTN3A3	O00478	584 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	E2F3	O00716	465 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR7A17	O14581	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KLF11	O14901	512 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	B4GAT1	O43505	415 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	STK16	O75716	305 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TSPAN9	O75954	239 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINE1	P05121	402 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RET	P07949	1114 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	S1PR1	P21453	382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IMPA1	P29218	277 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A12	P48065	614 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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