RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 RDH8Q9NYR8 311 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 RASD1Q9Y272 281 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 DOCK1Q14185 1865 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 FEZF1A0PJY2 475 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 GLOD5A6NK44 160 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PRRT4C9JH25 899 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF878C9JN71 531 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 FZD7O75084 574 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SNAPC5O75971 98 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 UBOX5O94941 541 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 KLKB1P03952 638 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 RHCEP18577 417 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PCYT1AP49585 367 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SGSHP51688 502 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SPERTQ8NA61 448 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 GATSQ8NAP1 163 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SLC30A2Q9BRI3 323 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf98E9PRG8 122 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PDE5AO76074 875 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 MT-ATP6P00846 226 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 BMI1P35226 326 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ERVK-16P61578 105 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 FAM180BQ6P0A1 224 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZS52 159 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ST8SIA1Q92185 356 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PDXPQ96GD0 296 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 C5AR2Q9P296 337 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CBR3O75828 277 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CHRNB1P11230 501 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PRKACBP22694 351 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 HOXA6P31267 233 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ATP1B3P54709 279 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SIRPAP78324 504 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 KLRB1Q12918 225 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 FAM209AQ5JX71 171 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 IDNKQ5T6J7 187 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 S100ZQ8WXG8 99 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 OR10A4Q9H209 315 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 E7ESA3 106 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 H0YIV9 168 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ENTPD6O75354 484 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 DHFRP00374 187 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 STATHP02808 62 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 HLA-DPB1P04440 258 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PVRP15151 417 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 MAGEA6P43360 314 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 GPR19Q15760 415 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CD200R1Q8TD46 325 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL15Q96M94 604 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ADOQ96SZ5 270 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 MRI1Q9BV20 369 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF175Q9Y473 711 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 TSPAN11A1L157 253 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ANHXE9PGG2 379 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 ZMPSTE24O75844 475 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 PRSS56P0CW18 603 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 GNG2P59768 71 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CHRNEQ04844 493 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 CDK10Q15131 360 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 DCST2Q5T1A1 773 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRB-209ENST00000550857 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms