RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRADDQ15628 312 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HYAL4Q2M3T9 481 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MPPE1Q53F39 396 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SHEQ5VZ18 495 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C4orf50Q6ZRC1 276 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS41Q7RTY9 318 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR6M1Q8NGM8 313 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4L1Q8NH43 312 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ULK4Q96C45 1275 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LHX5Q9H2C1 402 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NOX3Q9HBY0 568 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKMY1Q9P2S6 941 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR132Q9UNW8 380 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A087X0K7 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KBTBD13C9JR72 458 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR46O15213 610 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAMP1O60894 148 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RDXP35241 583 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STK19P49842 368 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXW9Q5XUX1 488 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM91A1Q658Y4 838 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C6orf89Q6UWU4 347 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PEX5LQ8IYB4 626 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNKDQ8N490 385 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM86B1Q8N7N1 296 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPBQ8NG41 125 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4F17Q8NGA8 305 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL1F10Q8WWZ1 152 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4F4Q96R69 305 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A22Q9H936 323 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRBP1Q9UHY1 535 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 S4R3C0 116 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CACNA1GO43497 2377 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 URADA6NGE7 173 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SULT2B1O00204 365 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SELENOFO60613 162 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCNA2P20248 432 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACTN2P35609 894 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CSNK1G2P78368 415 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACKR1Q16570 336 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C4orf19Q8IY42 314 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GATSQ8NAP1 163 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAAR1Q96RJ0 339 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHIAQ9BZP6 476 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGT1Q9H0U3 335 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 A0A0J9YVX5 310 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPIPA2E9PIF3 369 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AKAP3O75969 853 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPN1P04843 607 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGAM1P18669 254 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNFSF10P50591 281 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL15RAQ13261 267 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TEX44Q53QW1 395 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RTL6Q6ICC9 239 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRT80Q6KB66 452 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SERPINA9Q86WD7 417 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGAM4Q8N0Y7 254 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PYROXD2Q8N2H3 581 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APOOQ9BUR5 198 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM245Q9H330 911 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAB39LQ9H9S4 337 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SWAP70Q9UH65 585 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB23Q9ULC3 237 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR34Q9UPC5 381 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DHRS7Q9Y394 339 aa-0.11□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SDR42E2A6NKP2 422 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OVOL1O14753 267 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTDSPLO15194 276 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGSF6O95976 241 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VIMP08670 466 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMC3P17980 439 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LIM2P55344 173 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ST8SIA6P61647 398 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPS6P62753 249 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC34A1Q06495 639 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNFRSF9Q07011 255 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB35Q15286 201 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms