RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503219.5

SH3BP2-206, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-206ENST00000503219 POC1BQ8TC44 478 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 COQ8BQ96D53 544 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 PINK1Q9BXM7 581 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 PNPOQ9NVS9 261 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 SPG11Q96JI7 2443 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 A0A1W2PPR1 153 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 ALG1L2C9J202 215 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 NDUFB5O43674 189 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 IL18BPO95998 194 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 SERPINE1P05121 402 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 PEPDP12955 493 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 TBXA2RP21731 343 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 MAPK1P28482 360 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 SLC6A8P48029 635 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 IST1P53990 364 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 HBA1P69905 142 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 PHC1P78364 1004 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 TP53BP2Q13625 1128 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 POU4F3Q15319 338 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 PGS1Q32NB8 556 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 GGNQ86UU5 652 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 STARD4Q96DR4 205 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 TM9SF2Q99805 663 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 RASSF1Q9NS23 344 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 AKAP6Q13023 2319 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 F8P00451 2351 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP2-206ENST00000503219 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 SLC22A20A6NK97 555 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 A6NNC1 897 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 ESPNB1AK53 854 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 AQP8O94778 261 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 SHC1P29353 583 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 SLC1A6P48664 564 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 PRIM2P49643 509 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 EMX2Q04743 252 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 PON3Q15166 354 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 BCL2A1Q16548 175 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CBLN3Q6UW01 205 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CDC20BQ86Y33 519 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 DUSP26Q9BV47 211 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 NUF2Q9BZD4 464 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 PIGUQ9H490 435 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 TTC36A6NLP5 189 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 C9JVG2 144 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CFLARO15519 480 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 EFNA2O43921 213 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 11.4
SH3BP2-206ENST00000503219 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CPOXP36551 454 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CLDN8P56748 225 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 ZNF117Q03924 483 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 FAM27E3Q08E93 113 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CDC73Q6P1J9 531 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 ANKRD46Q86W74 232 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 MEIOBQ8N635 442 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 RNF145Q96MT1 663 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP2-206ENST00000503219 OR7D2Q96RA2 312 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms