RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497327.1

GGPS1-208, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, human

TSL 3

Gene GGPS1, Length 868 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGPS1-208	ENST00000497327	NAT6	Q93015	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	LRGUK	Q96M69	825 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	HYKK	A2RU49	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327		H3BUI4	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SGK494	L7N484	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CLIC1	O00299	241 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ARPC2	O15144	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CHST10	O43529	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FKBP6	O75344	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	KCNK5	O95279	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CPNE6	O95741	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	RET	P07949	1114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CD59	P13987	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FOLR1	P15328	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GGT1	P19440	569 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	UQCRC2	P22695	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CPN2	P22792	545 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GCK	P35557	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	GNAL	P38405	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TPTE	P56180	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	RAB38	P57729	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	RHD	Q02161	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FLOT2	Q14254	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	RGN	Q15493	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SERPINA11	Q86U17	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	MICU2	Q8IYU8	434 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CSF3R	Q99062	836 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GGPS1-208	ENST00000497327	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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