RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A1O15245 554 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 APOL3O95236 402 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GRK5P34947 590 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TGFBR2P37173 567 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZIC1Q15915 447 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NAT6Q93015 286 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 BMFQ96LC9 184 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR51E2Q9H255 320 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LILRA5A6NI73 299 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TLR4O00206 839 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TBX19O60806 448 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ENTPD6O75354 484 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ADORA3P0DMS8 318 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GABRB1P18505 474 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ALAS2P22557 587 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HAAOP46952 286 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 XKP51811 444 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 UGT2B15P54855 530 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FUT5Q11128 374 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 DGUOKQ16854 277 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 VRK2Q86Y07 508 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TCEANCQ8N8B7 351 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NUP43Q8NFH3 380 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC9A6Q92581 669 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC38A4Q969I6 547 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ARSGQ96EG1 525 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 WDR92Q96MX6 357 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MKLN1Q9UL63 735 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SNX7Q9UNH6 387 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR6C74A6NCV1 312 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZAR1LA6NP61 321 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FCMRO60667 390 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CTSVO60911 334 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ICAM2P13598 275 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AVPR1BP47901 424 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KHKP50053 298 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AKR1D1P51857 326 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SNTA1Q13424 505 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CASP12Q6UXS9 341 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RERGLQ9H628 205 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CLN6Q9NWW5 311 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KCND3Q9UK17 655 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CLDN24A6NM45 220 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 E9PQ18 207 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 H0YC42 278 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 K7ENP7 123 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 P2RX6O15547 441 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PROM1O43490 865 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PIAS2O75928 621 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 EPPINO95925 133 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OSMP13725 252 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 F3P13726 295 aa6.53□□□□□ -1.36
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