RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	OR10A5	Q9H207	317 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MED12	Q93074	2177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ORC5	O43913	435 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	DNAJB6	O75190	326 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	KDM4B	O94953	1096 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GKN3P	P0CG01	181 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	BMP7	P18075	431 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	RRAD	P55042	308 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	EFR3A	Q14156	821 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	IL11RA	Q14626	422 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74	4e-6	■□□□□ 8.5
TRA2B-215	ENST00000492417	SYPL1	Q16563	259 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF613	Q6PF04	617 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ROPN1L	Q96C74	230 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417		Q96MT0	163 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	POLH	Q9Y253	713 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ROS1	P08922	2347 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417		H7C2Y5	167 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CASK	O14936	926 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CLPX	O76031	633 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TIAF1	O95411	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	FURIN	P09958	794 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF28	P17035	718 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PRKACB	P22694	351 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	BSG	P35613	385 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CDKN2C	P42773	168 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GSTM5	P46439	218 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CD83	Q01151	205 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	DEFA5	Q01523	94 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	RELA	Q04206	551 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MERTK	Q12866	999 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM53B	Q14153	422 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	FGF11	Q92914	225 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MCHR1	Q99705	422 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PCM1	Q15154	2024 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417		A0A096LPI6	279 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417		A0A1W2PS29	197 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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