RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 CCDC63Q8NA47 563 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 PDPRQ8NCN5 879 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 OR2L2Q8NH16 312 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 C10orf82Q8WW14 230 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 OR14A2Q96R54 314 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 GPHA2Q96T91 129 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 MECRQ9BV79 373 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 NELFAQ9H3P2 528 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 PLCE1Q9P212 2302 aa6.79□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 G3V4G9 280 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 EBAG9O00559 213 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SGTAO43765 313 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ZBTB14O43829 449 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 CTSVO60911 334 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SMIM24O75264 130 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 DCTN3O75935 186 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 TOX4O94842 621 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 C8GP07360 202 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 UGT1A6P19224 532 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 IMPDH1P20839 514 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SHMT2P34897 504 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 UGT2B10P36537 528 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC1A6P48664 564 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 TRPC1P48995 793 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 AP1S2P56377 157 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 RPA4Q13156 261 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 RIN1Q13671 783 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM189A2Q15884 450 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 NRF1Q16656 503 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SBSNQ6UWP8 590 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 DEF8Q6ZN54 512 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 PROX1Q92786 737 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 NEUROG1Q92886 237 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 FAR2Q96K12 515 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SORT1Q99523 831 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 LPAR4Q99677 370 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 BCO1Q9HAY6 547 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ESM1Q9NQ30 184 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 OARD1Q9Y530 152 aa6.78□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 A0A1W2PP18 115 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 CD8B2A6NJW9 211 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 GFYI3L273 518 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC16A6O15403 523 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 CD8AP01732 235 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ANXA5P08758 320 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 NEFHP12036 1026 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 CHRM3P20309 590 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 MSH3P20585 1137 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 PTPN6P29350 595 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 CCR7P32248 378 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 CD79BP40259 229 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 DNASE1L1P49184 302 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 HNMTP50135 292 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 DIO3P55073 304 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 TGFBIQ15582 683 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 OR4D1Q15615 310 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 TBCCQ15814 346 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 USP43Q70EL4 1123 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 GPSM1Q86YR5 675 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.77□□□□□ -1.32
TRDMT1-210ENST00000488990 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.77□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms