RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 KCNE5Q9UJ90 142 aa29.95■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 A0A1B0GVC2 190 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 KIAA0513O60268 411 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 H6PDO95479 791 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 PPIBP23284 216 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 NFYCQ13952 458 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 TOMM20Q15388 145 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MAPK11Q15759 364 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CD226Q15762 336 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 COQ5Q5HYK3 327 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 OR4K17Q8NGC6 315 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 PRR7Q8TB68 274 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MYLK2Q9H1R3 596 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 DSN1Q9H410 356 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 LDAHQ9H6V9 325 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MED11Q9P086 117 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ZNF835Q9Y2P0 537 aa29.94■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 LOC100653049A0A140TA62 436 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 BBIP1A8MTZ0 92 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SUSD5O60279 629 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 HCN1O60741 890 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 KRT34O76011 436 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CHRM4P08173 479 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 BMP2P12643 396 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 HPCAP84074 193 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ZNF141Q15928 474 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 RUNDC3AQ59EK9 446 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CGREF1Q99674 301 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SLC38A1Q9H2H9 487 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 P2RX2Q9UBL9 471 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ADAM21Q9UKJ8 722 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 OSGIN2Q9Y236 505 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 DTNAQ9Y4J8 743 aa29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 FASNP49327 2511 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SLC19A2O60779 497 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 UGT2B17O75795 530 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 NR2F1P10589 423 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CHRNEQ04844 493 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 PDZK1Q5T2W1 519 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 REP15Q6BDI9 236 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MISPQ8IVT2 679 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ZNF619Q8N2I2 560 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 C10orf111Q8N326 155 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 OR2B2Q9GZK3 357 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 RUBCNLQ9H714 662 aa29.92■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 TNFRSF21O75509 655 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 NUDT7P0C024 238 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 TFPTP0C1Z6 253 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SRD5A2P31213 254 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MMEL1Q495T6 779 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 EIPR1Q53HC9 387 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ZNF614Q8N883 585 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 NEIL3Q8TAT5 605 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD27Q96NW4 1050 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CCT8L2Q96SF2 557 aa29.91■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 AQP7O14520 342 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 STSP08842 583 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 GPX2P18283 190 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 PTGS2P35354 604 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MAPK14Q16539 360 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 TREML1Q86YW5 311 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 POU5F2Q8N7G0 328 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SLC38A5Q8WUX1 472 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ZG16BQ96DA0 208 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 EXO5Q9H790 373 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 HHATLQ9HCP6 504 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 SPRR3Q9UBC9 169 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 CORO2BQ9UQ03 480 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa29.9■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 EVPLLA8MZ36 301 aa29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MRASO14807 208 aa29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 BCHEP06276 602 aa29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 ABOP16442 354 aa29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 DTNBP1Q96EV8 351 aa29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 TRIM8Q9BZR9 551 aa29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 DKKL1Q9UK85 242 aa29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CHKB-210ENST00000484266 MYO18BQ8IUG5 2567 aa29.89■■■□□ 2.37
CHKB-210ENST00000484266 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa29.89■■■□□ 2.37
CHKB-210ENST00000484266 DPP4P27487 766 aa29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms