RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TUBGCP3Q96CW5 907 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PSKH2Q96QS6 385 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF607Q96SK3 696 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 P2RX2Q9UBL9 471 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 OBSL1O75147 1896 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CUBNO60494 3623 aa4.89□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF222A6NCQ9 220 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC169A6NNP5 214 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 CDK2AP2O75956 126 aa4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 HPRP00739 348 aa4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 GLRA1P23415 457 aa4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 TAF13Q15543 124 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TEAD2Q15562 447 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIP10Q15642 601 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RTL6Q6ICC9 239 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PARP8Q8N3A8 854 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 OSTF1Q92882 214 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RTP4Q96DX8 246 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PCED1BQ96HM7 432 aa4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 HACD3Q9P035 362 aa4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa4.88□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 B4GAT1O43505 415 aa4.87□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 GPIP06744 558 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 UMODP07911 640 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SFTPCP11686 197 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 DPP4P27487 766 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPN6P29350 595 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CDC25AP30304 524 aa4.87□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 GPR17Q13304 367 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMD5Q16401 504 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 HLA-BQ31612 363 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 FHL5Q5TD97 284 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC39A4Q6P5W5 647 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CBLN3Q6UW01 205 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SPNS3Q6ZMD2 512 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TUBA1AQ71U36 451 aa4.87□□□□□ -1.63
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STRADBP1-201ENST00000478954 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 TCEANCQ8N8B7 351 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4C3Q8NH37 302 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 OR1L3Q8NH93 324 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SCRN2Q96FV2 425 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 LRR1Q96L50 414 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.87□□□□□ -1.63
STRADBP1-201ENST00000478954 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
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