RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNMB4Q86W47 210 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 NTNG2Q96CW9 530 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM62Q9BVG3 475 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 IKZF5Q9H5V7 419 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR41Q9HAD4 459 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF160Q9HCG1 818 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 GCNT4Q9P109 453 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 RASD1Q9Y272 281 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 GMPPBQ9Y5P6 360 aa5.09□□□□□ -1.59
RABGGTB-209ENST00000473406 DOCK7Q96N67 2140 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 C9JVG2 144 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 HAS3O00219 553 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 BUB3O43684 328 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 CST1P01037 141 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS1P07477 247 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TPM1P09493 284 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 OR9G9P0C7N8 305 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 PLA2G2AP14555 144 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 IMPDH1P20839 514 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.63e-28■□□□□ 10.7
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP2K2P36507 400 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL4P36578 427 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 OPRL1P41146 370 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 POU3F4P49335 361 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ERVK-16P61578 105 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 OGDHQ02218 1023 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM52BQ4KMG9 183 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TP53I3Q53FA7 332 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 APOOLQ6UXV4 268 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 STOX1Q6ZVD7 989 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TBCKQ8TEA7 893 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 HAVCR1Q96D42 359 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJA3Q96EY1 480 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPKQ9BS16 269 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 NCANO14594 1321 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLON5A6NGN9 336 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPT3HB4E1H0 165 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf98E9PRG8 122 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 G3V2L1 256 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 P2RY10O00398 339 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF749O43361 778 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 SPOPO43791 374 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 NEMFO60524 1076 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 BBOX1O75936 387 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 DIRAS1O95057 198 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ALPLP05186 524 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 CD48P09326 243 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 MCF2P10911 925 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 TNNI1P19237 187 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 C21orf59P57076 290 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 CARD18P57730 90 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 INHBEP58166 350 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 UPP1Q16831 310 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 AADACL4Q5VUY2 407 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC26A9Q7LBE3 791 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 CEACAM19Q7Z692 300 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGGTB-209ENST00000473406 LUZP2Q86TE4 346 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms