RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	SMIM11A	P58511	58 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CARM1	Q86X55	608 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	VRK2	Q86Y07	508 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	THAP4	Q8WY91	577 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NTNG2	Q96CW9	530 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OMA1	Q96E52	524 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PIP5K1A	Q99755	562 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FAAH	O00519	579 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SEMA7A	O75326	666 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	REM1	O75628	298 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	UTS2	O95399	124 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	THRB	P10828	461 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP4B1	P13584	511 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OTX2	P32243	289 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT20	P35900	424 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	VHL	P40337	213 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OR1E2	P47887	323 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	MLF1	P58340	268 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	IL10RA	Q13651	578 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	COMTD1	Q86VU5	262 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMF1	Q92530	271 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	HGD	Q93099	445 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TMCO6	Q96DC7	493 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	EPYC	Q99645	322 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ACER3	Q9NUN7	267 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	AK5	Q9Y6K8	562 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PRQ8	180 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FFAR1	O14842	300 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	HS6ST1	O60243	411 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TPST2	O60704	377 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	IL12B	P29460	328 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	LIMS1	P48059	325 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF136	P52737	540 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529		Q0VFX4	171 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SNTA1	Q13424	505 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DGCR6	Q14129	220 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIP10	Q15642	601 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	NTRK2	Q16620	822 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	DCAF10	Q5QP82	559 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OPN5	Q6U736	354 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF550	Q7Z398	422 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	MISP	Q8IVT2	679 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TRAF4-208	ENST00000469529	FGF11	Q92914	225 aa		11.71	□□□□□ -0.53

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