RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427641.2

NCBP2-204, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene NCBP2, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-204	ENST00000427641	CAPZB	P47756	277 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ETV1	P50549	477 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	GNA13	Q14344	377 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	NOXA1	Q86UR1	476 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	LYRM4	Q9HD34	91 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	THADA	Q6YHU6	1953 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	HMGN4	O00479	90 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	EMC8	O43402	210 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	GIPR	P48546	466 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	SKP1	P63208	163 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ZNF607	Q96SK3	696 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	DAPP1	Q9UN19	280 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	CCDC182	A6NF36	153 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	FABP12	A6NFH5	140 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	MYL12B	O14950	172 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	YES1	P07947	543 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ST6GAL1	P15907	406 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	MYL9	P24844	172 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	CEBPE	Q15744	281 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	TAB1	Q15750	504 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	LINC00471	Q8N535	108 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	MORN4	Q8NDC4	146 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	OR51I1	Q9H343	314 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	RNF121	Q9H920	327 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641		H3BN98	237 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	SLC28A2	O43868	658 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PRKCA	P17252	672 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PRKAG1	P54619	331 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	WNT4	P56705	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	PPP1CA	P62136	330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	GALK2	Q01415	458 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	RIN1	Q13671	783 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NCBP2-204	ENST00000427641	GINS1	Q14691	196 aa		13.43	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms