RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 A8MUA0 341 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF13O43567 381 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHA1P01876 353 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RRASP10301 218 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 C6P13671 934 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PTNP21246 168 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 THBS2P35442 1172 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM23P36406 574 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 FZD5Q13467 585 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMK2DQ13557 499 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF77Q15935 545 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC36A2Q495M3 483 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 BBS10Q8TAM1 723 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RGMAQ96B86 450 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD1Q96SE0 405 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC23A2Q9UGH3 650 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 LIPT1Q9Y234 373 aa17.12■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 NFATC1O95644 943 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 NPR2P20594 1047 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ACSL1P33121 698 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 BMP8BP34820 402 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CCR8P51685 355 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCD3Q6STE5 483 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4Q3Q8NH05 313 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP76Q8TAP6 659 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 NXPE2Q96DL1 559 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf58Q96GQ5 468 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A3Q96HJ5 214 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TM7SF3Q9NS93 570 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA4GQ9NTN9 838 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SOX30O94993 753 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 KHKP50053 298 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN31Q12999 210 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 LYPD4Q6UWN0 246 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RTL4Q6ZR62 310 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS42Q7Z5A4 293 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 LHFPL5Q8TAF8 219 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SUN3Q8TAQ9 357 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 LRIG1Q96JA1 1093 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 MACROD1Q9BQ69 325 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 AIFM2Q9BRQ8 373 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNN2Q9H2S1 579 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 WASH6PQ9NQA3 447 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa17.11■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 MEIKINA0A087WXM9 373 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PS29 197 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR171O14626 319 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SURF4O15260 269 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN9O75954 239 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC2A10O95528 541 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CFDP00746 253 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 DNASE1P24855 282 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SSR2P43308 183 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PUDPQ08623 228 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 HACD4Q5VWC8 232 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCK2Q7Z695 626 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 GPAT4Q86UL3 456 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 VRK2Q86Y07 508 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRG3Q86Y34 549 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 AICDAQ9GZX7 198 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CERS4Q9HA82 394 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 PELI2Q9HAT8 420 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL2L10Q9HD36 194 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 DLL4Q9NR61 685 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 RASD1Q9Y272 281 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 NTNG1Q9Y2I2 539 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP290O15078 2479 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GVI7 797 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SULT1A3P0DMM9 295 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SULT1A4P0DMN0 295 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 GIFP27352 417 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 SHC1P29353 583 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR4P46093 362 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 REEP5Q00765 189 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 DUSP2Q05923 314 aa17.1■□□□□ 0.33
RALGPS1-208ENST00000424082 MESP2Q0VG99 397 aa17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms