RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 MEAF6Q9HAF1 191 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ELOVL3Q9HB03 270 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 IL1RL2Q9HB29 575 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 FANCEQ9HB96 536 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 HOXC10Q9NYD6 342 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 TAS2R16Q9NYV7 291 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 SEC14L4Q9UDX3 406 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 MGAT4AQ9UM21 535 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 FKBP7Q9Y680 259 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 HCFC1P51610 2035 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 A0A0J9YVX5 310 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 A0A1W2PPR1 153 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 TTC26A0AVF1 554 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 LRIT2A6NDA9 550 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 METTL21EPA6NDL7 271 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 OR52A4PA6NMU1 304 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 H0YL77 283 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 K7ERI5 159 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CLDN5O00501 218 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ARPC3O15145 178 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF264O43296 627 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 LRRTM2O43300 516 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 PDE5AO76074 875 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 IGSF6O95976 241 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 AGTP01019 485 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 IGHG3P01860 377 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CHRNA1P02708 482 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 HOXB7P09629 217 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 SLC35G4P0C7Q5 338 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 POLR2MP0CAP2 368 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 GSTT2P0CG29 244 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 GSTT2BP0CG30 244 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 STAG3L3P0CL85 134 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 SLC2A3P11169 496 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 PSMA2P25787 234 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CALML3P27482 149 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 OXTRP30559 389 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 SPRP35270 261 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 HTR5AP47898 357 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 NOVP48745 357 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 FNTAP49354 379 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 PRMT2P55345 433 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 HAND2P61296 217 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ACY1Q03154 408 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 PAX8Q06710 450 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CD300CQ08708 224 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 FGL1Q08830 312 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 BST1Q10588 318 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ARHGAP19Q14CB8 494 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 DPYSL2Q16555 572 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CDKN3Q16667 212 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 PCK2Q16822 640 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM225Q6GV28 225 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 RFWD3Q6PCD5 774 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CLEC2AQ6UVW9 174 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 STOX1Q6ZVD7 989 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CATSPER3Q86XQ3 398 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 EFCAB13Q8IY85 973 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF683Q8IZ20 524 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CENPSQ8N2Z9 138 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 Q8N377 158 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ARL14Q8N4G2 192 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 C4orf32Q8N8J7 132 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 OR9K2Q8NGE7 335 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 SLC2A14Q8TDB8 520 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 STARD8Q92502 1023 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 PEX13Q92968 403 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ADIPOR1Q96A54 375 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF597Q96LX8 424 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 NPY6RQ99463 290 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 VGLL1Q99990 258 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 BCL7BQ9BQE9 202 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 SLC39A3Q9BRY0 314 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 TTYH2Q9BSA4 534 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 NUP58Q9BVL2 599 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 JPT2Q9H910 190 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 LPAR2Q9HBW0 351 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-207ENST00000418674 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
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