RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPN2P22792 545 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SOAT1P35610 550 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLCN2P51788 898 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DSTNP60981 165 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCAF7P61962 342 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDK6Q00534 326 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSPB3Q12988 150 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCARB2Q14108 478 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM53BQ14153 422 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCTE1Q5JU00 501 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q5PR19 223 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COX15Q7KZN9 410 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD163Q86VB7 1156 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIAH3Q8IW03 269 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR56A1Q8NGH5 318 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FKBP10Q96AY3 582 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q96MF0 132 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC29A1Q99808 456 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDR54Q9H977 334 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTSFQ9UBX1 484 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa8.77□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C7orf72A4D263 438 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM64BA6NI03 449 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLOD5A6NK44 160 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IDSB3KWA1 339 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMGN4O00479 90 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARHGEF9O43307 516 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EMC8O43402 210 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPST1O60507 370 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BMP10O95393 424 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFNA14P01570 189 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPINA7P05543 415 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FHP07954 510 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TFPTP0C1Z6 253 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGAMP11215 1152 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIR2DL3P43628 341 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRIM2P49643 509 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAB38P57729 211 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SKP1P63208 163 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SELENOWP63302 87 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DUSP2Q05923 314 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PMPCAQ10713 525 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAPK11Q15759 364 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NDUFA9Q16795 377 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CA13Q8N1Q1 262 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SVOPLQ8N434 492 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TANKQ92844 425 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAL2Q969L2 176 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C7orf34Q96L11 122 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FRMD6Q96NE9 622 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CIB1Q99828 191 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DOHHQ9BU89 302 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRB3Q9BUF7 120 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q9H521 79 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPACA6W5XKT8 324 aa8.76□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A087WV62 115 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DLGAP1O14490 977 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SOCS2O14508 198 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPR37O15354 613 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FOXS1O43638 330 aa8.75□□□□□ -1.01
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJB6O75190 326 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms