RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF836Q6ZNA1 936 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 NRMQ8IXM6 262 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FOXQ1Q9C009 403 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HOXD1Q9GZZ0 328 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ABCB9Q9NP78 766 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 POLE3Q9NRF9 147 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 GPR52Q9Y2T5 361 aa22.14■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TRAPPC13A5PLN9 417 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FAM221BA6H8Z2 402 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 POM121BA6NF01 834 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 PLOD3O60568 738 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 EML2O95834 649 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ATP1B1P05026 303 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SDC2P34741 201 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 OR2B6P58173 313 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 STARD6P59095 220 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 PPP2CBP62714 309 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 PPP3R1P63098 170 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 PPP2CAP67775 309 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RUNX2Q13950 521 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF619Q8N2I2 560 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF649Q9BS31 505 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HOXB2P14652 356 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZXDAP98168 799 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 MAP4K2Q12851 820 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 BCL2A1Q16548 175 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 DUSP5Q16690 384 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SPACA6W5XKT8 324 aa22.13■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FABP12A6NFH5 140 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 J3QRE1 110 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 STX11O75558 287 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 GUSBP08236 651 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CHRNB1P11230 501 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 UGT2B7P16662 529 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 DRD1P21728 446 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HTR3AP46098 478 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 YPEL5P62699 121 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SLC30A6Q6NXT4 461 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FAM131AQ6UXB0 335 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 Q6ZS52 159 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 NRARPQ7Z6K4 114 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 MSANTD3Q96H12 275 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TPK1Q9H3S4 243 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CBLCQ9ULV8 474 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HTR3EA5X5Y0 456 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 MAGP20916 626 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RFX2P48378 723 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FABP5Q01469 135 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 BAK1Q16611 211 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FCRL6Q6DN72 434 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RAB43Q86YS6 212 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TMEM255BQ8WV15 326 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SIPA1Q96FS4 1042 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 PRSS27Q9BQR3 290 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SLC22A4Q9H015 551 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A7Q9UM01 511 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TMEM5Q9Y2B1 443 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 NID1P14543 1247 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ACTR1BP42025 376 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ACTR1AP61163 376 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 MXD1Q05195 221 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 GAS6Q14393 721 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TMEM203Q969S6 136 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SOSTQ9BQB4 213 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 UBQLN3Q9H347 655 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 IL21RQ9HBE5 538 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 UNC119BA6NIH7 251 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CTSVO60911 334 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CD53P19397 219 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SOX18P35713 384 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K8P41279 467 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 GPR4P46093 362 aa22.1■■□□□ 1.13
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