RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409972.5

RBMS1-205, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-205ENST00000409972 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 C8orf44Q96CB5 159 aa20.08■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 WDR54Q9H977 334 aa20.08■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ARRDC5A6NEK1 342 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 MT-CO3P00414 261 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SMIM11AP58511 58 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 TAS2R41P59536 307 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 BLMHQ13867 455 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 DESI1Q6ICB0 168 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PRR22Q8IZ63 422 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF614Q8N883 585 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF441Q8N8Z8 693 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF555Q8NEP9 628 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 TMCC3Q9ULS5 477 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.07■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 FAAHO00519 579 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 AP3D1O14617 1153 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ADAM11O75078 769 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 CYP7B1O75881 506 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 IL33O95760 270 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 HTR2AP28223 471 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 DECR1Q16698 335 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 TMEM154Q6P9G4 183 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PISDQ9UG56 409 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 OR6C76A6NM76 312 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 STK17BO94768 372 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 UMODP07911 640 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 RAB15P59190 212 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 DCAF7P61962 342 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NPRL3Q12980 569 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 FGFBP1Q14512 234 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 STPG1Q5TH74 334 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 GABARAPL3Q9BY60 117 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SDK2Q58EX2 2172 aa20.06■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF292O60281 2723 aa20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 TO15178 435 aa20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 TAAR9Q96RI9 348 aa20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 A0A087WUU8 490 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 OR10H3O60404 316 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NBL1P41271 181 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 RNF4P78317 190 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 RAPSNQ13702 412 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NCF4Q15080 339 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 KLHL26Q53HC5 615 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF691Q5VV52 312 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SPRY4Q9C004 299 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 POFUT2Q9Y2G5 429 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 C9orf172C9J069 976 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 BCKDKO14874 412 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 UGT2B11O75310 529 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ST3GAL3Q11203 375 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 HES3Q5TGS1 186 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 APOOLQ6UXV4 268 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 GLRX5Q86SX6 157 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NR4A3Q92570 626 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 ADOQ96SZ5 270 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PRRX2Q99811 253 aa20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 SERINC4A6NH21 518 aa20.03■□□□□ 0.8
RBMS1-205ENST00000409972 H3BNH8 94 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms