RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409617.5

SERF2-208, Transcript of small EDRK-rich factor 2, human

TSL 2

Gene SERF2, Length 700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF2-208	ENST00000409617	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	OR14I1	A6ND48	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	C17orf51	A8MQB3	221 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	AQP7	O14520	342 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	KIAA0513	O60268	411 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	UGT2B17	O75795	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	TRAPPC6A	O75865	159 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	KRT34	O76011	436 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	H6PD	O95479	791 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	STS	P08842	583 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	TFPT	P0C1Z6	253 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NPIPA8	P0DM63	369 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NR2F1	P10589	423 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	MSX1	P28360	303 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SRD5A2	P31213	254 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CHRNE	Q04844	493 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	STX5	Q13190	355 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NFYC	Q13952	458 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	GPR68	Q15743	365 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SYPL1	Q16563	259 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	DSN1	Q9H410	356 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	LDAH	Q9H6V9	325 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	MED11	Q9P086	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	POLE	Q07864	2286 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NCKAP5	O14513	1909 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617		H3BNH8	94 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SLC19A2	O60779	497 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	FAM107A	O95990	144 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CHRM4	P08173	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	PTGS2	P35354	604 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ADH7	P40394	386 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	HPCA	P84074	193 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	GNA13	Q14344	377 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CD226	Q15762	336 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	REP15	Q6BDI9	236 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	GATS	Q8NAP1	163 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	MRAS	O14807	208 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ZIC3	O60481	467 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NUDT7	P0C024	238 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	COX4I1	P13073	169 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ABO	P16442	354 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	DPP4	P27487	766 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	CRISP3	P54108	245 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	KCNC4	Q03721	635 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	TOMM20	Q15388	145 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	MAPK14	Q16539	360 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	EIPR1	Q53HC9	387 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SERF2-208	ENST00000409617	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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