RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 FGF21Q9NSA1 209 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 STARD5Q9NSY2 213 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 EXOC1Q9NV70 894 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 VDAC3Q9Y277 283 aa4.94□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PN81 502 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa4.93□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 EPOP01588 193 aa4.93□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.92□□□□□ -1.62
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CCL20-201ENST00000358813 ITGA2P17301 1181 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 ITGB6P18564 788 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 TNFRSF1BP20333 461 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 ALDH4A1P30038 563 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 DNA2P51530 1060 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 GEMP55040 296 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-201ENST00000358813 RPS21P63220 83 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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