RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 MMP21Q8N119 569 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 PIGKQ92643 395 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF649Q9BS31 505 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZBP1Q9H171 429 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 CXorf36Q9H7Y0 433 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 CKAP5Q14008 2032 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 CH25HO95992 272 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 MAP4K2Q12851 820 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 PDE7AQ13946 482 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 CAMK1Q14012 370 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 NDUFA9Q16795 377 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 CD300LDQ6UXZ3 194 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF354BQ96LW1 612 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 DMRTA2Q96SC8 542 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 TMEM202A6NGA9 273 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 RNF13O43567 381 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SELENOFO60613 162 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 TAS2R50P59544 299 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SP140Q13342 867 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SCARB1Q8WTV0 552 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 FNDC11Q9BVV2 318 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ACTR6Q9GZN1 396 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 KLHL42Q9P2K6 505 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 MGAT4CQ9UBM8 478 aa15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PRQ8 180 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 GRM6O15303 877 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 B3GALNT1O75752 331 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 MAPK9P45984 424 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 DHODHQ02127 395 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 TEAD2Q15562 447 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 PAQR7Q86WK9 346 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 CA10Q9NS85 328 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 PIPOXQ9P0Z9 390 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ANHXE9PGG2 379 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ABCD4O14678 606 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 UBXN7O94888 489 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 CTSAP10619 480 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ATP6V1E1P36543 226 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 KCNJ5P48544 419 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 VEGFCP49767 419 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 PRMT2P55345 433 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 ACSM1Q08AH1 577 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 FZD5Q13467 585 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 OR8K3Q8NH51 312 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 OR51B5Q9H339 312 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.71■□□□□ 0.11
GDE1-201ENST00000353258 TRABD2BA6NFA1 517 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 TYRP14679 529 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 E2F1Q01094 437 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 TMEM215Q68D42 235 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 IKBIPQ70UQ0 350 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SLITRK4Q8IW52 837 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 OR2A12Q8NGT7 310 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 OR52N1Q8NH53 320 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 THAP4Q8WY91 577 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SLC38A3Q99624 504 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF33A8MVX0 844 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 MPC1LP0DKB6 136 aa15.7■□□□□ 0.1
GDE1-201ENST00000353258 HTR4Q13639 388 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms