RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 NAXEQ8NCW5 288 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OR4C3Q8NH37 302 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 NUDT8Q8WV74 236 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 RTN4RQ9BZR6 473 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 CLCA1A8K7I4 914 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 B4DXG7 233 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 HDAC3O15379 428 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 CTSSP25774 331 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 CLDN18P56856 261 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 HBA1P69905 142 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 TLE4Q04727 773 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 CCNJQ5T5M9 372 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OGFOD2Q6N063 350 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 APOOLQ6UXV4 268 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF527Q8NB42 609 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OR4A15Q8NGL6 344 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 WNT2BQ93097 391 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 TESCQ96BS2 214 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 UCN2Q96RP3 112 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 STOML1Q9UBI4 398 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 A0A087WZY1 265 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 GMFGO60234 142 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 IL18BPO95998 194 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 UQCRC1P31930 480 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF136P52737 540 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 DCST2Q5T1A1 773 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZAR1Q86SH2 424 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 GATSQ8NAP1 163 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 MED4Q9NPJ6 270 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 PKDREJQ9NTG1 2253 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 FREM3P0C091 2139 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 A0A1W2PQD3 144 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OR2M5A3KFT3 312 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 DUXAA6NLW8 204 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 H3BNH8 94 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 MYBPHQ13203 477 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 SLC35G5Q96KT7 338 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 LURAP1Q96LR2 239 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF559Q9BR84 538 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 E9PBE3 544 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 H3BML4 177 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 SYT5O00445 386 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 SDHDO14521 159 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 RCBTB2O95199 551 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 AK1P00568 194 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 KITP10721 976 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF17P17021 662 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 S100A3P33764 101 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ARSKQ6UWY0 536 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 OR7D2Q96RA2 312 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 ZBTB18Q99592 522 aa14.52□□□□□ -0.08
ATG4B-201ENST00000344376 AIG1Q9NVV5 245 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms