RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 LALBAP00709 142 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 PRKAR1AP10644 381 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 GCGRP47871 477 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 FABP5Q01469 135 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 RHAGQ02094 409 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 ENTPD8Q5MY95 495 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 CDC73Q6P1J9 531 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 TMIEQ8NEW7 156 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 IL23AQ9NPF7 189 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 MGAT4AQ9UM21 535 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 WDR45Q9Y484 360 aa18.58■□□□□ 0.57
SPNS2-201ENST00000329078 LYRM1O43325 122 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJB6O75190 326 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 NT5EP21589 574 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 REEP5Q00765 189 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 RPA4Q13156 261 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 FAM27D1Q5T7N8 215 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 GJA4P35212 333 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 KLHL22Q53GT1 634 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SLC36A4Q6YBV0 504 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 CHMP1BQ7LBR1 199 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 GALNT11Q8NCW6 608 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SETD6Q8TBK2 473 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PIGKQ92643 395 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 WDR34Q96EX3 536 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ACVR1BP36896 505 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ETV6P41212 452 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SNTA1Q13424 505 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 FCN2Q15485 313 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 GLRX5Q86SX6 157 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 CREB3L4Q8TEY5 395 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SMARCD2Q92925 531 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 AIFM2Q9BRQ8 373 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 GON7Q9BXV9 100 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SLC25A19Q9HC21 320 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MAFFQ9ULX9 164 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SPATA2Q9UM82 520 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 DPM1O60762 260 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 HRGP04196 525 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PEPDP12955 493 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ARSBP15848 533 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 DRD3P35462 400 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MAB21L1Q13394 359 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 AICDAQ9GZX7 198 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ICKQ9UPZ9 632 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 HYKKA2RU49 373 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MAN2B1O00754 1011 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 EFCAB14O75071 495 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 IFNGR2P38484 337 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 FAM111BQ6SJ93 734 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MS4A6EQ96DS6 147 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PRRC1Q96M27 445 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PCBD2Q9H0N5 130 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SYNPO2LQ9H987 977 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 KCND3Q9UK17 655 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 LEUTXA8MZ59 168 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PRG2P13727 222 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MZT2BQ6NZ67 158 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 CHIAQ9BZP6 476 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PELI2Q9HAT8 420 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 A0A075B6Q4 140 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 LINC01553A4QN01 128 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF81P51508 661 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PRMT2P55345 433 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 ST3GAL3Q11203 375 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 BTN1A1Q13410 526 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 FGL2Q14314 439 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 TRAM2Q15035 370 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MEDAGQ5VYS4 303 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA1211LQ6NV74 962 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 PATE1Q8WXA2 126 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 KATNB1Q9BVA0 655 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 IFT27Q9BW83 186 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SRMSQ9H3Y6 488 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 SLC6A20Q9NP91 592 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS2-201ENST00000329078 MARK1Q9P0L2 795 aa18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms