RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318709.8

AVL9-201, Transcript of AVL9 cell migration associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AVL9, Length 6,982 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9-201ENST00000318709 NFS1Q9Y697 457 aa14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 TAAR8Q969N4 342 aa14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 C4orf36Q96KX1 117 aa14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 GNB4Q9HAV0 340 aa14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 AIG1Q9NVV5 245 aa14.6□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 ARSBP15848 533 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 SPOCK1Q08629 439 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 IGSF21Q96ID5 467 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 CD300AQ9UGN4 299 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 CDK1P06493 297 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 NTHL1P78549 312 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 OR2T4Q8NH00 348 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 J3KTA2 159 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 LBX1P52954 281 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 NKX3-2P78367 333 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 SLC10A1Q14973 349 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 OR51E2Q9H255 320 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 POLHQ9Y253 713 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 RAB3DO95716 219 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 GAAP10253 952 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 RPA2P15927 270 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 GGT1P19440 569 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 TAP2Q03519 686 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 MICAQ29983 383 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 PNCKQ6P2M8 343 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 BATF2Q8N1L9 274 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 PIGRP01833 764 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 SERPINE2P07093 398 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 CBR1P16152 277 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 KDELC1Q6UW63 502 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 CPOQ8IVL8 374 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 SOBPA7XYQ1 873 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 RAB15P59190 212 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 BORAQ6PGQ7 559 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 ARL11Q969Q4 196 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 PRAMEF2O60811 474 aa14.58□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 OPRL1P41146 370 aa14.58□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 TLE1Q04724 770 aa14.58□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.58□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.58□□□□□ -0.07
AVL9-201ENST00000318709 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 RDH16O75452 317 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 SLC2A1P11166 492 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 CHRNB1P11230 501 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 40.5
AVL9-201ENST00000318709 MYLIPQ8WY64 445 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 TXNDC15Q96J42 360 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 APMAPQ9HDC9 416 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 B4GAT1O43505 415 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 ATG12O94817 140 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 KCNE1P15382 129 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 RAB31Q13636 194 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 SFXN2Q96NB2 322 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 KLF11O14901 512 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 LYRM1O43325 122 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 GJB3O75712 270 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 STC2O76061 302 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 GSRP00390 522 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 MT-CO2P00403 227 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 ARSAP15289 507 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.58□□□□□ -0.08
AVL9-201ENST00000318709 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms