RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 PTHLHP12272 177 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 ADH7P40394 386 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 OR10G6Q8NH81 332 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 PPA2Q9H2U2 334 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 CD93Q9NPY3 652 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 DUX4Q9UBX2 424 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.34□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 CDK2AP1O14519 115 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 CA12O43570 354 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 ZNF30P17039 623 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 HCCSP53701 268 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 TPBGQ13641 420 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 OPCMLQ14982 345 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 AANATQ16613 207 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 C17orf107Q6ZR85 190 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 PARGQ86W56 976 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 ZG16BQ96DA0 208 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 SFXN2Q96NB2 322 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 ZNF558Q96NG5 402 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 GSX2Q9BZM3 304 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 MLXQ9UH92 298 aa14.33□□□□□ -0.11
USP25-201ENST00000285679 HLA-DQA2P01906 255 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 ITGB7P26010 798 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 NNATQ16517 81 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 ARTNQ5T4W7 220 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 TMEM99Q8N816 258 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 NEURL3Q96EH8 262 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 TMEM129A0AVI4 362 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 K7ESM1 405 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 RAD1O60671 282 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 VNN2O95498 520 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 OR12D2P58182 307 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 GMFBP60983 142 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 TEKQ02763 1124 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 STK11Q15831 433 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 C18orf63Q68DL7 685 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 C12orf73Q69YU5 71 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 FBXL6Q8N531 539 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 NUP43Q8NFH3 380 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 OR56A3Q8NH54 315 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 ABHD1Q96SE0 405 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 IL36AQ9UHA7 158 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 KCNK6Q9Y257 313 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 TSC2P49815 1807 aa14.33□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 SLCO2B1O94956 709 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 FBXO45P0C2W1 286 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 HBMQ6B0K9 141 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 NUS1Q96E22 293 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 MED11Q9P086 117 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 LIPCP11150 499 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 MPIP34949 423 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 OMPP47874 163 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 LINC00471Q8N535 108 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 FIBINQ8TAL6 211 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 ST8SIA4Q92187 359 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 SGTBQ96EQ0 304 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 POT1Q9NUX5 634 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 LRRC72A6NJI9 287 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 RP2O75695 350 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 RPN2P04844 631 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 C8AP07357 584 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 AHCYP23526 432 aa14.32□□□□□ -0.12
USP25-201ENST00000285679 GDNFP39905 211 aa14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms