RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 PARGQ86W56 976 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR52A5Q9H2C5 316 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 RNF215Q9Y6U7 377 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 IL12BP29460 328 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 TPRA1Q86W33 373 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 UBAC2Q8NBM4 344 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 OR56A3Q8NH54 315 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 SLC23A1Q9UHI7 598 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRO-201ENST00000281171 TRAV18A0A075B6X5 111 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 C20orf202A1L168 122 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 LEUTXA8MZ59 168 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 C5AR1P21730 350 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 USP51Q70EK9 711 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SLC9B2Q86UD5 537 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CHTF18Q8WVB6 975 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PIGVQ9NUD9 493 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MED16Q9Y2X0 877 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SCO2O43819 266 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TNFP01375 233 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SCG5P05408 212 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SLC35E2BP0CK96 405 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 COX18Q8N8Q8 333 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 NETO1Q8TDF5 533 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MAFKO60675 156 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 RCAN2Q14206 197 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ACTBL2Q562R1 376 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM150AQ86TG1 271 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 OR56B2PQ8NGI1 322 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 LINC01599Q8WXQ3 324 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 LMLNQ96KR4 655 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PRRT1Q99946 306 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GPR89AB7ZAQ6 455 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 P2RX6O15547 441 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GPR89BP0CG08 455 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TAS2R20P59543 309 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 RAB40BQ12829 278 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 PIM3Q86V86 326 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 FRMD1Q8N878 549 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 HCAR2Q8TDS4 363 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CRLF2Q9HC73 371 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 HS3ST4Q9Y661 456 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ANKUB1A6NFN9 424 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 IQCF5A8MTL0 148 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ENPP3O14638 875 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 BPIP17213 487 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 C1QTNF8P60827 252 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 IL13RA1P78552 427 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MEF2DQ14814 521 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 GTDC1Q4AE62 458 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CDH26Q8IXH8 852 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 NLGN2Q8NFZ4 835 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 OR56A1Q8NGH5 318 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 RHEBL1Q8TAI7 183 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SMARCD2Q92925 531 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SERINC1Q9NRX5 453 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CREBZFQ9NS37 354 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0B4J2A0 478 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM235A6NFC5 223 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA0355O15063 1070 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF44P15621 663 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 RAB11BQ15907 218 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 DBX2Q6ZNG2 339 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SHPKQ9UHJ6 478 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 MYH8P13535 1937 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 A0A087X0M5 115 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GX30 115 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 ANKRD66B4E2M5 251 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 M0R143 59 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 HAS3O00219 553 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 CD1EP15812 388 aa13.57□□□□□ -0.24
PTPRO-201ENST00000281171 SNCAP37840 140 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms