RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A1W2PPC4 97 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 UBXN7O94888 489 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ALOX5P09917 674 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF12P17014 697 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 COX10Q12887 443 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 GXYLT1Q4G148 440 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 GATSQ8NAP1 163 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CBX7O95931 251 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 IGKV1D-16P01601 117 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PRKAR1BP31321 381 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 TSPAN31Q12999 210 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CPOQ8IVL8 374 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PHC2Q8IXK0 858 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CYB561A3Q8NBI2 242 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 TP53INP1Q96A56 240 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PIGUQ9H490 435 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 A8MUA0 341 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 SSX4O60224 188 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 STX11O75558 287 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 SLITRK5O94991 958 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 SCG5P05408 212 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 GYPBP06028 91 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CLUP10909 449 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CRYBB2P43320 205 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 MTNR1AP48039 350 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 OR1Q1Q15612 314 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 FBXO43Q4G163 708 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 DESI1Q6ICB0 168 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ARL14Q8N4G2 192 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ASNA1O43681 348 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 IFI30P13284 250 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CD40LGP29965 261 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 GCGRP47871 477 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 EMDP50402 254 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 FXYD6P3P58550 94 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 EFNB1P98172 346 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 NCF4Q15080 339 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 STEAP3Q658P3 488 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 STK25O00506 426 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 GAS1P54826 345 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CDH11P55287 796 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 PSG6Q00889 435 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 STX4Q12846 297 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 KLHL12Q53G59 568 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM163Q8TC26 289 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 FGF11Q92914 225 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CALML5Q9NZT1 146 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 SYT5O00445 386 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ALAS2P22557 587 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 LIMK1P53667 647 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 CADM2Q8N3J6 435 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC20A1-201ENST00000272542 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.64□□□□□ -0.07
SLC20A1-201ENST00000272542 REM1O75628 298 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms