RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 TNP2Q05952 138 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PIGFQ07326 219 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AQP6Q13520 282 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TP53BP2Q13625 1128 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP1A4Q13733 1029 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DGCR6Q14129 220 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DOC2BQ14184 412 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NFE2L1Q14494 772 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF404Q494X3 552 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 COX20Q5RI15 118 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 METRNLQ641Q3 311 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A19Q695T7 634 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PNCKQ6P2M8 343 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT10Q86SR1 603 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NRROSQ86YC3 692 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LACC1Q8IV20 430 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP21Q8N119 569 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ESX1Q8N693 406 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MCFD2Q8NI22 146 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GGHQ92820 318 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TANKQ92844 425 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LURAP1Q96LR2 239 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CSF3RQ99062 836 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LGR4Q9BXB1 951 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MROQ9BYG7 248 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SP140LQ9H930 580 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SIAEQ9HAT2 523 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ACER3Q9NUN7 267 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TAC3Q9UHF0 121 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 MKLN1Q9UL63 735 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 POLEQ07864 2286 aa6.56□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT87PA6NCN2 255 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZAR1LA6NP61 321 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 J3QRK9 145 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZW10O43264 779 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1F1O43749 312 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ZG16O60844 167 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLITRK5O94991 958 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 AGR2O95994 175 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 VIPP01282 170 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 APOA1P02647 267 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OPN1SWP03999 348 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NR2F1P10589 423 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 OSMP13725 252 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFS1P28331 727 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 BSGP35613 385 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SSR2P43308 183 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR3P46089 330 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 LIMS1P48059 325 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CCT3P49368 545 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CRISP3P54108 245 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1024LP59773 190 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK3Q00526 305 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 DMPKQ09013 629 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ST3GAL4Q11206 333 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC9A5Q14940 896 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 NCF4Q15080 339 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.55□□□□□ -1.36
SMARCE1-201ENST00000264640 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.55□□□□□ -1.36
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