RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FOLR1P15328 257 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF79Q15937 498 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD4BQ5TF39 518 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NXNL2Q5VZ03 156 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT12Q8IXK2 581 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2E3Q969T4 207 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NLNQ9BYT8 704 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 A4GALTQ9NPC4 353 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 DMRT3Q9NQL9 472 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 DYRK1BQ9Y463 629 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 IRGMA1A4Y4 181 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SSX4O60224 188 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TPST2O60704 377 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ADRA2AP08913 450 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCR2P25025 360 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 RDH10Q8IZV5 341 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00471Q8N535 108 aa24.52■■□□□ 1.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM60AQ9NP50 221 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC400499M0QZD8 3231 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R129 80 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TAP2Q03519 686 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 TBRG1Q3YBR2 411 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DCST1Q5T197 706 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 NEIL2Q969S2 332 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ISYNA1Q9NPH2 558 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf172C9J069 976 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf58C9J3I9 102 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 MYL12BO14950 172 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 ALPPP05187 535 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 POU1F1P28069 291 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA9Q16795 377 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 VWA5B2Q8N398 1253 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PSD4Q8NDX1 1056 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2A1Q8NGT9 310 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 AP3S1Q92572 193 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 NXPE2Q96DL1 559 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SNTG1Q9NSN8 517 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXJ2Q9P0K8 574 aa24.51■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 CD180Q99467 661 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQ09 198 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSBP07858 339 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 XKP51811 444 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 COX10Q12887 443 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53BP2Q13625 1128 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 HEPACAMQ14CZ8 416 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 BAK1Q16611 211 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 LAX1Q8IWV1 398 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PHC2Q8IXK0 858 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM26EQ8N5C1 309 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A6Q92536 515 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C1Q96RD1 312 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH7Q9H992 704 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SOHLH2Q9NX45 425 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SDK2Q58EX2 2172 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX19O60806 448 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 CPEP16870 476 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPR19Q15760 415 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 ADNP2Q6IQ32 1131 aa24.49■■□□□ 1.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 LIX1LQ8IVB5 337 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CREB3L4Q8TEY5 395 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 NEURL3Q96EH8 262 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 IL4I1Q96RQ9 567 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A1Q9NY26 324 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 EPG5Q9HCE0 2579 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC16AO15027 2179 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CDRT15L2A8MXV6 281 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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