RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233084.7

DDX1-201, Transcript of DEAD-box helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX1, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1-201ENST00000233084 LRG1P02750 347 aa14.77□□□□□ -0.05
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DDX1-201ENST00000233084 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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DDX1-201ENST00000233084 A0A1W2PPK0 400 aa14.74□□□□□ -0.05
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