RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.64■□□□□ 0.9
HTATSF1-201ENST00000218364 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 NPR2P20594 1047 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 F8A1P23610 371 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 BTCP35070 178 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 PITPNBP48739 271 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 PDX1P52945 283 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ERVK-21P61565 698 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 HACD4Q5VWC8 232 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35A4Q96G79 324 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC8Q9BY41 377 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 B3GNT2Q9NY97 397 aa20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM183AA6NL82 134 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 CRYZL1O95825 349 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 AHRP35869 848 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM205BPQ63HN1 556 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB7BQ96AH8 199 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SCMH1Q96GD3 660 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 C12orf66Q96MD2 445 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCG5Q9H222 651 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 STMN3Q9NZ72 180 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 PAICSP22234 425 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 CERS1P27544 350 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 NUDT1P36639 197 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 TSFMP43897 325 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SIGIRRQ6IA17 410 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 CDC73Q6P1J9 531 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 PLBD1Q6P4A8 553 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 FRRS1Q6ZNA5 592 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC6A20Q9NP91 592 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 CACNG2Q9Y698 323 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 FABP7O15540 132 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 RFPL3O75679 317 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SHC1P29353 583 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 FCN2Q15485 313 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 TPRA1Q86W33 373 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ING5Q8WYH8 240 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR137Q96N19 417 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SARGQ9BW04 601 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 GHITMQ9H3K2 345 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.63■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 CEBPBP17676 345 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ACSL1P33121 698 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 GALEQ14376 348 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF234Q14588 700 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM99Q8N816 258 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 OR5W2Q8NH69 310 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 MED28Q9H204 178 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 DUXAA6NLW8 204 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 DHFRP00374 187 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAM1Q15629 374 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR135Q8IZ08 494 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SAMD12Q8N8I0 201 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS15Q8TE58 950 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52D1Q9H346 318 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 INPP5EQ9NRR6 644 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 RASD1Q9Y272 281 aa20.62■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 PLPP2O43688 288 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ESCO2Q56NI9 601 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SDE2Q6IQ49 451 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SFXN4Q6P4A7 337 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX101Q9BY14 249 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 EMC7Q9NPA0 242 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 NTMQ9P121 344 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ING4Q9UNL4 249 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0G2JK05 382 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 ANTXRLA6NF34 631 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 UNC119BA6NIH7 251 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.61■□□□□ 0.89
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR89BP0CG08 455 aa20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms