RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 RFT1Q96AA3 541 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PRRC1Q96M27 445 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 AUNIPQ9H7T9 357 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 BRD7Q9NPI1 651 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SERTM1A2A2V5 107 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SIGLEC5O15389 551 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ITGB8P26012 769 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 C1orf94Q6P1W5 598 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 UBE2E3Q969T4 207 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OR5F1O95221 314 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 THY1P04216 161 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ADRB3P13945 408 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ACADLP28330 430 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TOR2AQ5JU69 321 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM111BQ6SJ93 734 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CDH24Q86UP0 819 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 C4orf36Q96KX1 117 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 FKRPQ9H9S5 495 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.21■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 QSOX1O00391 747 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TPBGQ13641 420 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF671Q8TAW3 534 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC20Q8TCA0 184 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM74BQ9NUR3 256 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SEC16AO15027 2179 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CSNK1G2P78368 415 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MINDY4Q4G0A6 757 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CDC73Q6P1J9 531 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 HCAR2Q8TDS4 363 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC41A3Q96GZ6 507 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CERS4Q9HA82 394 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CA5BQ9Y2D0 317 aa16.2■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR2W5A6NFC9 320 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PEX12O00623 359 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 LDB3O75112 727 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 BNC1Q01954 994 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM31Q5JXX7 168 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 VASNQ6EMK4 673 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 MZT2AQ6P582 158 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SIAH3Q8IW03 269 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR10A4Q9H209 315 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM5Q9Y2B1 443 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SNTNA6NMZ2 147 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 IDSB3KWA1 339 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF13O43567 381 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 C1QBP02746 253 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ADRB1P08588 477 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CEBPBP17676 345 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 KHKP50053 298 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAM2Q15035 370 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 DEFB134Q4QY38 66 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 HES5Q5TA89 166 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 THSD4Q6ZMP0 1018 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 GDF7Q7Z4P5 450 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 OR8K3Q8NH51 312 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CBLCQ9ULV8 474 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 FRMPD3Q5JV73 1810 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A1B0GVT2 93 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 LEUTXA8MZ59 168 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC31A1O15431 190 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ACADMP11310 421 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 EPHA5P54756 1037 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 CLDN20P56880 219 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 SSX6Q7RTT6 188 aa16.19■□□□□ 0.18
KCNQ1-201ENST00000155840 TOMM5Q8N4H5 51 aa16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms