RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1B0GTQ1 180 aa22.18■■□□□ 1.14
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RPUSD1-201ENST00000007264 FMO6PO60774 539 aa22.18■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 NTN1O95631 604 aa22.18■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 NR0B2Q15466 257 aa22.18■■□□□ 1.14
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RPUSD1-201ENST00000007264 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 GABARAPO95166 117 aa22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PIPP12273 146 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 MEDAGQ5VYS4 303 aa22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1-201ENST00000007264 SAP25Q8TEE9 199 aa22.15■■□□□ 1.14
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