RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000202170.3

Pds5b-208, Transcript of Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Pds5b, Length 6,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pot1bH7BX60 640 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm11236J3QMS7 360 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cd83O88324 196 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cry1P97784 606 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Psg28Q4KL66 472 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mc2rQ64326 296 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr871Q7TRF0 311 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc22a22Q8R0S9 554 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr1099Q8VG37 312 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Oosp1Q925U0 202 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Trappc6bQ9D289 158 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Twsg1Q9EP52 222 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ccl26F8VQM2 93 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 OmgQ63912 440 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Med26Q7TN02 588 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 DdnQ80TS7 710 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Q80VP5 184 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cdk3Q80YP0 303 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Nfatc4Q8K120 901 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Atg5Q99J83 275 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fbxo36Q9CQ24 188 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ms4a4bQ9ES61 226 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Kcnk7Q9Z2T1 307 aa14.9□□□□□ -0.02
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr613E9PYB4 317 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn2r99H3BK37 856 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Atp5j2P56135 88 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cdkn3Q810P3 211 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ugt2b38Q91WH2 530 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Efcab11Q9D0E5 162 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn1r52Q9EP79 309 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc7a11Q9WTR6 502 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Loxl3Q9Z175 754 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ino80eA0A0U1RP99 260 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mamld1P0C6A2 803 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pou2f1P25425 770 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 CelQ64285 599 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cept1Q8BGS7 416 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Bpifb2Q8C1E1 462 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 EloaQ8CB77 773 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 1700020N01RikQ8CF20 87 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc31a1Q8K211 196 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 MallQ91X49 154 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Pop7Q9DCH2 140 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Esp18A8R0V1 91 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm20390E9PZF0 267 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm8024L7N2E0 100 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 C4bpaP08607 469 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 HnrnpkP61979 463 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rsl1Q7M6Y1 485 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Q8C5S3 137 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Angptl6Q8R0Z6 457 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr729Q8VET4 323 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm4969D3YZT1 566 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ppt1O88531 306 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 CtseP70269 397 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 CbarpQ66L44 698 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Lrit2Q6PFC5 549 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Zfp874aQ8BX23 447 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Tor2aQ8R1J9 321 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 St6galnac4Q9R2B6 360 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm11239E9Q5Z9 360 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm11237F2Z3W5 360 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm11238F2Z478 360 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 RoraP51448 523 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Siah1bQ06985 282 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm428Q3UTE2 360 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm10330Q8BKS1 112 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fam149aQ8CFV2 787 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gpr18Q8K1Z6 331 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Uqcc2Q9CQY6 136 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Psmd8Q9CX56 353 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc25a27Q9D6D0 322 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 GghQ9Z0L8 317 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rhox2dW4VSN9 191 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mrc1Q61830 1456 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gm1123Q1RME4 390 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Uap1l1Q3TW96 507 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Slc35a1Q61420 336 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Olfr776Q7TRI3 312 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 PcgF3Q8BTQ0 241 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Wdr37Q8CBE3 496 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Fam155aQ8CCS2 467 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Steap3Q8CI59 488 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn1r84Q8R284 318 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Crtac1Q8R555 646 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Gipc3Q8R5M0 297 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Desi1Q9CQT7 168 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Srfbp1Q9CZ91 441 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Hey1Q9WV93 299 aa14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Mecp2Q9Z2D6 484 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa14.88□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Cnih2O35089 160 aa14.88□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Hsd3b6O35469 373 aa14.88□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Il1r2P27931 410 aa14.88□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Rsu1Q01730 277 aa14.88□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 Spire1Q52KF3 598 aa14.88□□□□□ -0.03
Pds5b-208ENSMUST00000202170 CalcrQ60755 533 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.9 ms