RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077853.4

Prpf4b-201, Transcript of Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf4b, Length 7,844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gde1Q9JL56 331 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mbd4Q9Z2D7 554 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ms4a4aA0A087WRT7 236 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 A0A1L1SV24 88 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cd300ld4A2A7W1 245 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm8159E9Q0R1 267 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cyp4a31F8WGU9 509 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fcn1O70165 334 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Upp1P52624 311 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 ActbP60710 375 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Actg1P63260 375 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zfp39Q02525 718 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fezf1Q0VDQ9 475 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 MyorgQ69ZQ1 716 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cd300ld3Q6SJQ5 245 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr885Q7TRE0 309 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rnf38Q8BI21 518 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zfp763Q8BIC7 588 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Unc5dQ8K1S2 956 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr134Q8VG95 312 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam96bQ9D187 163 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 TrirQ9D735 173 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc15a1Q9JIP7 709 aa8.3□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 NalcnQ8BXR5 1738 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Kif13aQ9EQW7 1749 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zfp81B8JJZ7 531 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tcf3P15806 651 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cd48P18181 240 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 TpoP35419 914 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Npbwr1P49681 329 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem202Q80W35 275 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem150cQ8C8S3 249 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr353Q8VGK0 311 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Park7Q99LX0 189 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tnfsf13Q9D777 241 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc34a2Q9DBP0 697 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm28710A0A1B0GR31 962 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr287E9PZS7 322 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Xkr6E9Q6C8 638 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ceacam3E9Q6J4 706 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr730E9Q8M3 318 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tcte3P11985 191 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr1136Q0VBI4 310 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 EgflamQ4VBE4 1017 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ankrd28Q505D1 1053 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Yod1Q8CB27 343 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Krt33aQ8K0Y2 404 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 CenpiQ8K1K4 746 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 SharpinQ91WA6 380 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc9a3r2Q9JHL1 337 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Sec61a2Q9JLR1 476 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc7a9Q9QXA6 487 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cldn6Q9Z262 219 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr1247A2AT78 314 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Agtr1bP29755 359 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Epha6Q62413 1035 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Adgrd1Q80T32 903 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 A730061H03RikQ8BGD2 154 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc16a14Q8K1C7 512 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Itfg2Q91WI7 443 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lap3Q9CPY7 519 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rp2Q9EPK2 347 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tubd1Q9R1K7 455 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm6619F6URP1 175 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr1425K7N659 312 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rad52P43352 420 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Defa11P50709 85 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Six5P70178 719 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cln6Q3U466 308 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc39a12Q5FWH7 689 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zp1Q62005 623 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Taf6Q62311 678 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Smad2Q62432 467 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ranbp10Q6VN19 620 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Coq4Q8BGB8 266 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Eif1axQ8BMJ3 144 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr1426Q8VG74 311 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mgat4cQ9D306 478 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Wfdc16A2A5H4 111 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tex264E9Q137 309 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Dmp1O55188 503 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gja1P23242 382 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 TesP47226 423 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Eml4Q3UMY5 988 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pcsk7Q61139 770 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zik1Q80YP6 463 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 LdahQ8BVA5 326 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 MastlQ8C0P0 865 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 EtfdhQ921G7 616 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Dhrs4Q99LB2 279 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cmtm8Q9CZR4 173 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rab13Q9DD03 202 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Psmg2Q9EST4 264 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lpar2Q9JL06 348 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms