RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022224.15

Trappc13-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc13, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13-201ENSMUST00000022224 PnckQ9QYK9 343 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Thbs4Q9Z1T2 963 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Myo10F8VQB6 2062 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Plxna2P70207 1894 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Eml5Q8BQM8 1977 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ttc39aA2ACP1 578 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Aadacl2B2RWD2 401 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Il20rbE9Q9A6 308 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ccdc7bE9Q9Y3 381 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Maml2F6U238 1170 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr631F8VPJ9 319 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr1249L7MU51 318 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ephb6O08644 1014 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 C1dO35473 141 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cst3P21460 140 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 VipP32648 170 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ptx3P48759 381 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ccr3P51678 359 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Nrg2P56974 756 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Slc16a3P57787 470 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 SnrpgP62309 76 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cct3P80318 545 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ankdd1bQ14DN9 521 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 PomkQ3TUA9 349 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ctu2Q3U308 514 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Coq8bQ566J8 533 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ppp3r2Q63811 179 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sf1Q64213 653 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Irf4Q64287 450 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Q6P1I3 445 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr871Q7TRF0 311 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Prr5Q812A5 387 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Slc38a9Q8BGD6 560 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ccdc126Q8BIS8 140 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 PpcdcQ8BZB2 204 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Crlf2Q8CII9 359 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 PiguQ8K358 434 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Osgin1Q8VC10 478 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Zdhhc5Q8VDZ4 715 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr380Q8VGT3 311 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vsx1Q91V10 363 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Spred2Q924S7 410 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sfxn1Q99JR1 322 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Abcg5Q99PE8 652 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cmtm8Q9CZR4 173 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 HhatlQ9D1G3 503 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Pfn3Q9DAD6 137 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tssc4Q9JHE7 317 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sphk2Q9JIA7 617 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Pdzk1Q9JIL4 519 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Dnaja4Q9JMC3 397 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Enpp2Q9R1E6 862 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ramp2Q9WUP0 189 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ccr9Q9WUT7 369 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Kcnd3Q9Z0V1 655 aa7.36□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 4930433I11RikA0A0U1RPT6 723 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 SpaarA0A1B0GSZ0 75 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr74A2BHP6 318 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Pdzd8B9EJ80 1147 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr543E9PWI5 336 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr287E9PZS7 322 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cyp2j8G3UZ38 503 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Shisa8J3QNX5 399 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn2r93L7N1Z9 857 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gtpbp1O08582 668 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ulk1O70405 1051 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gabra3P26049 492 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Fli1P26323 452 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cdh26P59862 763 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 UrodP70697 367 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Yes1Q04736 541 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tmem248Q3TBN1 314 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Garem1Q3UFT3 876 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Med22Q62276 200 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 NanogQ80Z64 305 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Hyal5Q812F3 526 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Nipal3Q8BGN5 410 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Lcmt2Q8BYR1 686 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Zhx3Q8C0Q2 951 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr551Q8VG23 315 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 MrgprdQ91ZB8 321 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Med6Q921D4 246 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tnfrsf12aQ9CR75 129 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Zbtb8aQ9CWH1 434 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tmem35aQ9D328 167 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Slc6a19Q9D687 634 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Dnase1l1Q9D7J6 314 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Pop7Q9DCH2 140 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sertad3Q9ERC3 197 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Bin3Q9JI08 253 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Insm2Q9JMC2 493 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cdc7Q9Z0H0 564 aa7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Eif2s3xQ9Z0N1 472 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Eif2s3yQ9Z0N2 472 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.7 ms