RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631166.1

HS1BP3-208, Transcript of HCLS1 binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene HS1BP3, Length 78 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HS1BP3-208	ENST00000631166	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF609	O15014	1411 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADRB1	P08588	477 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	TFF2	Q03403	129 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	PDE3A	Q14432	1141 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	PKN1	Q16512	942 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	IER5L	Q5T953	404 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	GPC2	Q8N158	579 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	ANKS1A	Q92625	1134 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	RUNDC1	Q96C34	613 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLIT3	O75094	1523 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	ARHGAP6	O43182	974 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	ALDH1A1	P00352	501 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	GJB1	P08034	283 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	CAPN2	P17655	700 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	SP8	Q8IXZ3	490 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	KANK1	Q14678	1352 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	SPEG	Q15772	3267 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL4A5	P29400	1685 aa		3.71	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		3.71	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	AOX1	Q06278	1338 aa		3.71	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		3.71	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.81
HS1BP3-208	ENST00000631166	NAIP	Q13075	1403 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	TLL1	O43897	1013 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	EPS15	P42566	896 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	LHX6	Q9UPM6	363 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	USP47	Q96K76	1375 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		3.71	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CDH23	Q9H251	3354 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	TAF4	O00268	1085 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	C21orf2	O43822	256 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	SREBF2	Q12772	1141 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CD320	Q9NPF0	282 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CPD	O75976	1380 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL4A3	Q01955	1670 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	USP54	Q70EL1	1684 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	FAM186A	A6NE01	2351 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	FBN2	P35556	2912 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	ERC2	O15083	957 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	DCX	O43602	365 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	GJD3	Q8N144	294 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIF12	Q96FN5	646 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	ITSN1	Q15811	1721 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		3.69	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	SDHB	P21912	280 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	IGFBP4	P22692	258 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	SP3	Q02447	781 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	RING1	Q06587	406 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	MTFR1	Q15390	333 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	ADAM32	Q8TC27	787 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	FSD1	Q9BTV5	496 aa		3.68	□□□□□ -1.82
HS1BP3-208	ENST00000631166	RNF208	Q9H0X6	261 aa		3.68	□□□□□ -1.82

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