RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 TBX22Q9Y458 520 aa10.68□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 SPTLC1O15269 473 aa10.67□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 AGERQ15109 404 aa10.67□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.67□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.66□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 PTSQ03393 145 aa10.66□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.66□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 WHAMMQ8TF30 809 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 OVOS2Q6IE36 1432 aa10.65□□□□□ -0.7
CTXN3-204ENST00000620385 FSHRP23945 695 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 MTHFSP49914 203 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 AAMPQ13685 434 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 WDR63Q8IWG1 891 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 SVOPQ8N4V2 548 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 USP6P35125 1406 aa10.64□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 KIF1AQ12756 1690 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 TTLL8A6PVC2 850 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 FYB1O15117 783 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 IRS1P35568 1242 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 SLFN5Q08AF3 891 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 PTPRUQ92729 1446 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.63□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 IL16Q14005 1332 aa10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 GJA5P36382 358 aa10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 CABP1Q9NZU7 370 aa10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 PIK3C2AO00443 1686 aa10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 FIGNL2A6NMB9 653 aa10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 NEFMP07197 916 aa10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.61□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 APAF1O14727 1248 aa10.6□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGEF15O94989 841 aa10.6□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 SLURP2P0DP57 97 aa10.6□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 LTKP29376 864 aa10.6□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 USP31Q70CQ4 1352 aa10.6□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 SSH2Q76I76 1423 aa10.59□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.59□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.59□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa10.59□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 WWC1Q8IX03 1113 aa10.59□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 COG3Q96JB2 828 aa10.59□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.59□□□□□ -0.71
CTXN3-204ENST00000620385 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.58□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.58□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.58□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.58□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.58□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 RTL1A6NKG5 1358 aa10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 IGHA1P01876 353 aa10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC116Q8IYX3 515 aa10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF428Q96B54 188 aa10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 PDE3AQ14432 1141 aa10.56□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 AMHR2Q16671 573 aa10.56□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.56□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 DCCP43146 1447 aa10.56□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.56□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 SLC35F4A4IF30 521 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 CBLBQ13191 982 aa10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CTXN3-204ENST00000620385 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms