RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	MCM6	Q14566	821 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	LIG1	P18858	919 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SPA17	Q15506	151 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC102B	Q68D86	513 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	ZBTB9	Q96C00	473 aa		12.95	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	METTL24	Q5JXM2	366 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806		A0A087WZG4	1122 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	FSD2	A1L4K1	749 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	POTEB2	H3BUK9	544 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SYK	P43405	635 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	DTNB	O60941	627 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	DNA2	P51530	1060 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SNRK	Q9NRH2	765 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	HYPK	Q9NX55	129 aa		12.94	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	ADGRL1	O94910	1474 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	INSR	P06213	1382 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	MCM3	P25205	808 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806		Q6ZUG5	572 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	MICU3	Q86XE3	530 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	NAPB	Q9H115	298 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	YEATS4	O95619	227 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	TAF4B	Q92750	862 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		12.93	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	CTR9	Q6PD62	1173 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	PKP1	Q13835	747 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	GTF3C6	Q969F1	213 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	ABCF2	Q9UG63	623 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	STRN4	Q9NRL3	753 aa		12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SOGA3	Q5TF21	947 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	GPATCH11	Q8N954	259 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	MSH6	P52701	1360 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	IFNK	Q9P0W0	207 aa		12.91	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SYCP1	Q15431	976 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	KIF20A	O95235	890 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	RUFY3	Q7L099	469 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	A2M	P01023	1474 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	PAFAH1B1	P43034	410 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
BECN1-222	ENST00000617806	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	FAM107B	Q9H098	131 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ATP10B	O94823	1461 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ACE	P12821	1306 aa		12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
BECN1-222	ENST00000617806	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.89	□□□□□ -0.35

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