RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617066.4

PRR5-217, Transcript of proline rich 5, human

TSL 5 BASIC

Gene PRR5, Length 1,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR5-217	ENST00000617066	APBB1	O00213	710 aa		40.38	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	40.38	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	FOXO4	P98177	505 aa		40.36	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		40.36	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	SMIM5	Q71RC9	77 aa		40.36	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	SCN7A	Q01118	1682 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	FAM89A	Q96GI7	184 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	PLSCR1	O15162	318 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	RGL2	O15211	777 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	RAB11FIP3	O75154	756 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	PROM2	Q8N271	834 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		40.32	■■■■■ 4.05
PRR5-217	ENST00000617066	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	TXNRD1	Q16881	649 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	AK7	Q96M32	723 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	NARF	Q9UHQ1	456 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	APBA3	O96018	575 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	40.29	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	40.29	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	40.28	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	PARP10	Q53GL7	1025 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	SYNE4	Q8N205	404 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	SUSD4	Q5VX71	490 aa		40.26	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		40.26	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	40.26	■■■■■ 4.04
PRR5-217	ENST00000617066	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		40.25	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		40.25	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		40.25	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	C4A	P0C0L4	1744 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	40.24	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	40.23	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	COPRS	Q9NQ92	184 aa		40.23	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		40.22	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	40.22	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	BACH2	Q9BYV9	841 aa		40.22	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	BCL11A	Q9H165	835 aa		40.22	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	ZPR1	O75312	459 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	ADRA2B	P18089	450 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	FAM161A	Q3B820	660 aa		40.2	■■■■■ 4.03
PRR5-217	ENST00000617066	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	PHF14	O94880	888 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	CSF1R	P07333	972 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		40.19	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	NTSR2	O95665	410 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	40.18	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	C8orf34	Q49A92	452 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	40.18	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		40.17	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		40.17	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	RFC4	P35249	363 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	MYH3	P11055	1940 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	SIL1	Q9H173	461 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	FAM177B	A6PVY3	158 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	PDE8A	O60658	829 aa		40.13	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	SASH1	O94885	1247 aa		40.13	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	SSFA2	P28290	1259 aa		40.13	■■■■■ 4.02
PRR5-217	ENST00000617066	CTSW	P56202	376 aa		40.13	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		40.12	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		40.11	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	40.1	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	PDE1A	P54750	535 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	LAMB2	P55268	1798 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	TTC22	Q5TAA0	569 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	AKT1S1	Q96B36	256 aa		40.08	■■■■■ 4.01
PRR5-217	ENST00000617066	ZNF827	Q17R98	1081 aa		40.07	■■■■■ 4
PRR5-217	ENST00000617066	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		40.07	■■■■■ 4
PRR5-217	ENST00000617066	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4
PRR5-217	ENST00000617066	SETDB2	Q96T68	719 aa		40.07	■■■■■ 4

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms