RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.66■□□□□ 0.9
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DGKZQ13574 1117 aa20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LTBP1Q14766 1721 aa20.63■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HLFQ16534 295 aa20.62■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRY2Q49AN0 593 aa20.62■□□□□ 0.89
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRKAR2BP31323 418 aa20.58■□□□□ 0.89
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC12Q96J65 1359 aa20.58■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NGEFQ8N5V2 710 aa20.57■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NOGQ13253 232 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.55■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VPS33BQ9H267 617 aa20.54■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.54■□□□□ 0.88
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.52■□□□□ 0.88
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.52■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.52■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUDCQ9Y266 331 aa20.51■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.51■□□□□ 0.87
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCTN1Q14203 1278 aa20.5■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NLRP3Q96P20 1036 aa20.5■□□□□ 0.87
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SUSD4Q5VX71 490 aa20.49■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC51AQ86UW1 340 aa20.49■□□□□ 0.87
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.48■□□□□ 0.87
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RAD17O75943 681 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYL6BP14649 208 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZIC5Q96T25 663 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 H7C1D1 291 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NTSR2O95665 410 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP48Q86UV5 1035 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGMBQ6NW40 437 aa20.44■□□□□ 0.86
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