RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584550.1

GGA3-219, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-219	ENST00000584550	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-219	ENST00000584550	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-219	ENST00000584550	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	HLF	Q16534	295 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	PSMD1	Q99460	953 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	CA12	O43570	354 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	SOX10	P56693	466 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	AOC3	Q16853	763 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-219	ENST00000584550	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	MCM10	Q7L590	875 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	GPT	P24298	496 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	CXCL9	Q07325	125 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	DCTN1	Q14203	1278 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	SHTN1	A0MZ66	631 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	RAD17	O75943	681 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	HUNK	P57058	714 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	NUP98	P52948	1817 aa		13.6	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	RGL2	O15211	777 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	NOG	Q13253	232 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
GGA3-219	ENST00000584550	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	TRPA1	O75762	1119 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	MYL6B	P14649	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550		H7C1D1	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	NTSR2	O95665	410 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	TNIP1	Q15025	636 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.55	□□□□□ -0.24
GGA3-219	ENST00000584550	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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