RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 ADRA2BP18089 450 aa29.16■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 SSH3Q8TE77 659 aa29.16■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 BCORQ6W2J9 1755 aa29.16■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 SRGAP3O43295 1099 aa29.15■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.15■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZPR1O75312 459 aa29.14■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHF14O94880 888 aa29.14■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLA2Q14181 598 aa29.14■■■□□ 2.26
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.14■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 USPL1Q5W0Q7 1092 aa29.13■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 RFC4P35249 363 aa29.13■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.13■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 BCL2L12Q9HB09 334 aa29.13■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.13■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 SSFA2P28290 1259 aa29.12■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 PARP10Q53GL7 1025 aa29.12■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 SCN7AQ01118 1682 aa29.12■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM89AQ96GI7 184 aa29.11■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 SKAP1Q86WV1 359 aa29.11■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.11■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUCB1Q02818 461 aa29.1■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 SUSD4Q5VX71 490 aa29.09■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 AKT1S1Q96B36 256 aa29.09■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 C4AP0C0L4 1744 aa29.09■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXO4P98177 505 aa29.08■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDHR2Q9BYE9 1310 aa29.08■■■□□ 2.25
RARA-AS1-201ENST00000581080 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF827Q17R98 1081 aa29.07■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.07■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.07■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.06■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBC1D9BQ66K14 1250 aa29.06■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.06■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYNE4Q8N205 404 aa29.06■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 BAG6P46379 1132 aa29.05■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.05■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa29.05■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 SH3TC1Q8TE82 1336 aa29.04■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 NTSR2O95665 410 aa29.03■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 SETDB2Q96T68 719 aa29.03■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 BICDL1Q6ZP65 573 aa29.02■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 LNPKQ9C0E8 428 aa29.02■■■□□ 2.24
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM177BA6PVY3 158 aa29.01■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 RGS3P49796 1198 aa29.01■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC125Q86Z20 511 aa29.01■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 APBB1O00213 710 aa28.99■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 CSF1RP07333 972 aa28.99■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 GYS1P13807 737 aa28.99■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.99■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 FLAD1Q8NFF5 587 aa28.99■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDE8AO60658 829 aa28.98■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAB11FIP3O75154 756 aa28.98■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDE4AP27815 886 aa28.98■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.98■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 COPRSQ9NQ92 184 aa28.98■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.98■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.96■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTSWP56202 376 aa28.96■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 NFIXQ14938 502 aa28.96■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.96■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 NYXQ9GZU5 481 aa28.96■■■□□ 2.23
RARA-AS1-201ENST00000581080 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.95■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.95■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.94■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC15A2Q16348 729 aa28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 MYH3P11055 1940 aa28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
RARA-AS1-201ENST00000581080 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.93■■■□□ 2.22
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