RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-205	ENST00000578348	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.79	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	STRN4	Q9NRL3	753 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	GCKR	Q14397	625 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	MYD88	Q99836	296 aa		13.78	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.77	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.2
GGA3-205	ENST00000578348	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	COL15A1	P39059	1388 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.77	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	TPM2	P07951	284 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	OFD1	O75665	1012 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.76	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	HSPA4	P34932	840 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	NBPF15	Q8N660	670 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	RAD50	Q92878	1312 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	BTG4	Q9NY30	223 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	SGSM2	O43147	1006 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	LRP6	O75581	1613 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GGA3-205	ENST00000578348	SASH1	O94885	1247 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	AACS	Q86V21	672 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	TJP1	Q07157	1748 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	AK2	P54819	239 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348		A0A087WZG4	1122 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	PHF14	O94880	888 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	CASP7	P55210	303 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	ITGB4	P16144	1822 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	A1BG	P04217	495 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	TTC14	Q96N46	770 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348		H7C1W4	665 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	CPA1	P15085	419 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-205	ENST00000578348	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22

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