RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-204	ENST00000577468	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	NUDT8	Q8WV74	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	COBL	O75128	1261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	PCSK7	Q16549	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	HIF1A	Q16665	826 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	SKI	P12755	728 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	NOS3	P29474	1203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	ABL2	P42684	1182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-204	ENST00000577468	PIK3CD	O00329	1044 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	IRAK1	P51617	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	NCOA4	Q13772	614 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	GSX2	Q9BZM3	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468		M0R2N6	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	FST	P19883	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	CD97	P48960	835 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	CCIN	Q13939	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	FAM35A	Q86V20	835 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	TTC9	Q92623	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	MAP3K6	O95382	1288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	SSTR4	P31391	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	IER5	Q5VY09	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	GSC2	O15499	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	NFKB1	P19838	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	GRIK5	Q16478	980 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	ALG2	Q9H553	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	DLL1	O00548	723 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	CPB1	P15086	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	EPB42	P16452	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	FZD5	Q13467	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-204	ENST00000577468	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPRM-204	ENST00000577468	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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