RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CRKLP46109 303 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF5P55010 431 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXO4P98177 505 aa35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 CASC1Q6TDU7 716 aa35.77■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C22orf23Q9BZE7 217 aa35.77■■■■□ 3.32
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUP98P52948 1817 aa35.76■■■■□ 3.32
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NUTM1Q86Y26 1132 aa35.75■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LMBR1LQ6UX01 489 aa35.74■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HLFQ16534 295 aa35.73■■■■□ 3.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTC41PQ6P2S7 1318 aa35.73■■■■□ 3.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 BTAF1O14981 1849 aa35.72■■■■□ 3.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 SASH1O94885 1247 aa35.71■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TSHZ3Q63HK5 1081 aa35.7■■■■□ 3.31
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLA2G12BQ9BX93 195 aa35.69■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIL1Q9H173 461 aa35.69■■■■□ 3.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NLRP10Q86W26 655 aa35.69■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPATCH3Q96I76 525 aa35.69■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDHR2Q9BYE9 1310 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 KLHDC4Q8TBB5 520 aa35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEPT12Q8IYM1 358 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 PI4K2BQ8TCG2 481 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERC2O15083 957 aa35.66■■■■□ 3.3
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CHMP3Q9Y3E7 222 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 SBF2Q86WG5 1849 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERICH6Q7L0X2 663 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 AACSQ86V21 672 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF34Q8IZ26 560 aa35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPTP24298 496 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ECHDC1Q9NTX5 307 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 AK9Q5TCS8 1911 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM89AQ96GI7 184 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC00116Q8NCU8 138 aa35.61■■■■□ 3.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 RILPL2Q969X0 211 aa35.61■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-208ENST00000573600 REC8O95072 547 aa35.56■■■■□ 3.28
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC57Q2TAC2 916 aa35.56■■■■□ 3.28
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IL15P40933 162 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.55■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TNNI3KQ59H18 835 aa35.54■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa35.54■■■■□ 3.28
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CTSWP56202 376 aa35.49■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF1LQ8IZX4 1826 aa35.49■■■■□ 3.27
CTDNEP1-208ENST00000573600 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TTLL11Q8NHH1 800 aa35.48■■■■□ 3.27
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