RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	MYH3	P11055	1940 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	TAF1	P21675	1872 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	SYNE4	Q8N205	404 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	PTPRC	P08575	1304 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	PLIN1	O60240	522 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	NTSR2	O95665	410 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	RGL2	O15211	777 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	ST5	P78524	1137 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	TRIM27	P14373	513 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	CHRNA5	P30532	468 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
RPL4-208	ENST00000564744	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744		A0A0G2JLW4	131 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	RLBP1	P12271	317 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	DPEP1	P16444	411 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	GCKR	Q14397	625 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	PANK1	Q8TE04	598 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ABCC4	O15439	1325 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	COL4A1	P02462	1669 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	SLX4	Q8IY92	1834 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	SYT17	Q9BSW7	474 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	10.74	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		10.74	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744		H0YIN7	160 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744		H7C1W4	665 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	GRM8	O00222	908 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	PDE6B	P35913	854 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	CASP7	P55210	303 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	SLC51A	Q86UW1	340 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	SUCLG2	Q96I99	432 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	MEIS3	Q99687	375 aa		10.72	□□□□□ -0.69
RPL4-208	ENST00000564744	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.72	□□□□□ -0.69

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